回族醫學是中國傳統醫學與阿拉伯-伊斯蘭醫學“東西合璧”的產物。當歐洲其他各國尚未脫離神學統治之時，阿拉伯人開始發展科學文化。他們開辦大學、建立圖書館，培養了大批人才，阿拉伯文化達到較高水平，在所有科目中，醫學是最主要的，也取得了巨大成就。

隨著阿拉伯人與鄰國的交往，鄰國文化隨之在阿拉伯諸國滲透，并互相補益，醫學上也是如此。伊斯蘭教創始人穆罕默德曾說過：“學問遠在中國，亦當求之”。中阿于公元651年正式友好往來，醫藥方面的交往也興于此時。因此許多阿拉伯學者，特別是一些哲學家不斷總結自己民族的醫療實踐經驗，同時還將其他國家的醫學著作譯成阿文。

早在公元7世紀，阿拉伯-伊斯蘭醫學曾居世界醫學的先進行列，并對西方現代化醫學有巨大影響。到中世紀，阿拉伯偉大的哲學家、科學家、醫學家阿維森納的足跡遍及伊拉克、波斯、阿塞拜疆、巴基斯坦大片土地。他一生大膽實踐，潛心鉆研，廣征博求，于公元980至1037年著成熔古希臘醫學、印度醫學、中國醫學、阿拉伯醫學與哲學于一爐的巨著――《醫典》，成為現代醫學和阿拉伯醫學的奠基人。中世紀阿拉伯醫學著作繁多，不少已散失，包括《醫典》在內，流傳至今尚有400多種。

中國回回醫學的發展，相伴于中阿醫藥交流。醫藥方面也興于唐代。金元之際醫學文化領域學術活躍，百家爭鳴，中醫界出現了金元四大學派，回回醫藥文化此時也發展到鼎盛時期，涌現了與回回藥物院有關的、集阿拉伯醫藥學與中國傳統醫學為一體，具有中國回回特色的醫藥大型綜合性醫著《回回藥方》等專著。