在臨床上梅毒可以分為一期梅毒、二期梅毒、三期梅毒。一期梅毒是梅毒螺旋體侵犯局部，引起局部的炎性反應;二期梅毒是通過皮膚、粘膜及淋巴進入血液，在血液中繁殖，表現于皮膚的較嚴重梅毒;三期梅毒是晚期梅毒，侵犯神經、血管、骨骼、關節，后果嚴重甚至危及生命。

一期梅毒一般在梅毒螺旋體感染后3周左右發生，主要表現為陰部的潰瘍也就是硬下疳。硬下疳的數目通常為1個，初起為無自覺癥狀的小紅斑，以后變為隆起的硬結，最后破潰、糜爛形成潰瘍。此階段為治療梅毒的最佳時期。

二期梅毒的臨床表現非常復雜，通常以皮膚玫瑰疹出現。發疹之前有類似感冒癥狀，可伴隨骨骼關節痛。二期梅毒皮膚疹可表現為斑疹型、丘疹型、苔蘚型、膿皰型及扁平疣等。但它們都有一些共同特點，就是無急性炎癥現象，界限清楚，有浸潤，可自然消退，無自覺癥狀。這個階段也可通過正規正確治療達到痊愈。

三期梅毒一般發生于感染4-5年后，開始出現皮膚粘膜晚期肉芽腫樣損害，約10—20年可侵犯心血管及中樞神經系統等重要器官，危害極大。三期梅毒梅毒血清學陽性率降低，甚至轉陰，傳染性較小。三期梅毒也可出現皮膚梅毒疹，以結節性梅毒疹和樹膠樣腫為主要表現。侵犯黏膜可形成間質性舌炎、梅毒性白斑、鞍鼻等。侵犯心血管系統較為常見，引起梅毒性主動脈炎、主動脈瓣閉鎖不全及主動脈瘤等。侵犯神經系統主要是梅毒性脊髓癆及全身性麻痹性癡呆。