部分患者因為不知道傳染性軟疣做什么檢查，可能會耽誤了治療，病情進一步發展后，進而影響到患者的正常生活。傳染性軟疣患者通常可以通過體格檢查、組織病理學檢查、染色檢查等方式進行檢查。
1.體格檢查：傳染性軟疣是由傳染性軟疣病毒引起的。臨床上很容易確診，患者可以到皮膚科就診，主要表現為皮損中心有臍狀凹陷，有蠟質光澤，含乳白色乳酪樣物質，容易擠壓。
2.組織病理學檢查：從患處取一小塊皮損，在顯微鏡下觀察，變性細胞內有許多嗜酸性包涵體，以后可以轉變為嗜堿性包涵體，也被稱為軟疣小體，軟疣小體內有許多病毒顆粒，電子顯微鏡可以看到表皮中有特征性的磚形痘病毒顆粒。
3.染色檢查：傳染性軟疣患者還可以通過染色檢查進行輔助檢查。通常情況下，醫生會把從皮損處擠壓出來的乳酪狀軟疣小體涂在玻璃片上，然后用復方碘溶液進行染色，就會變成深棕色，或者是用200倍生理鹽水稀釋后的亮晶藍溶液進行染色，就會變成青色。
患者在知道傳染性軟疣做什么檢查后，還應及時進行治療。