如果隱睪位于腹股溝管內及腹內高位或者睪丸缺如臨床檢查常常摸不到睪丸。Levitt統計臨床體檢摸不到的隱睪約占全部隱睪的20％。對于這些病人常常先作HCG刺激試驗即注射HCG1500IU，隔日1次，共3次注射前后檢查血清中睪丸酮水平，如果注射后血清睪丸酮水平升高，表示有功能性睪丸組織存在如果注射后血清睪丸酮水平不變，常表示沒有功能性睪丸組織存在。 對于臨床摸不到的隱睪常常需要采用特殊的診斷方法來做隱睪的定位檢查。B型超聲波檢查是目前最常用的方法，這種檢查無損傷且可以同時檢查病人有無腎積水畸形、結石等泌尿系統病變，對于腹股溝管內的隱睪有相當高的診斷率但對于腹內隱睪的診斷率還不夠高。選擇性精索內靜脈造影是一個曾經廣泛采用的方法，可從造影劑注入后的精索內靜脈末端形態來診斷隱睪的位置或者睪丸缺如但常常由于靜脈瓣影響了精索內靜脈顯影，而且對2歲以下的兒童操作很困難。電子計算機斷層掃描（CTScan）和核磁共振（MRI）近年來也用于腹內隱睪的定位診斷均有相當高的準確性，Wolverson報告20例病人作CT檢查，準確率達96％；Fritzche報告12例病人共15個隱睪經MRI證實14個隱睪1例高位誤診。這二種檢查的缺點是在年幼的兒童檢查比較困難而且費用很高。