卵巢性閉經指原發于卵巢本身的疾患或功能異常所致的閉經。可為先天的，亦可是后天的。卵巢性閉經診斷的2個主要內分泌指標是雌激素水平低落和促性腺激素水平升高。引起的原因通常有：卵巢早衰，卵巢切除或組織破壞，卵巢功能性腫瘤，多囊卵巢綜合征。

1、先天性無卵巢或發育不良：

大多由于性染色體異常所引起，包括特納氏(Turner)征(也稱先天性卵巢發育不全癥)和真性卵巢發育不全兩種類型。

2、卵巢損壞：

可由于放射治療，手術切除雙側卵巢，或因炎癥或腫瘤等使卵巢組織遭受損壞。

3、卵巢腫瘤：

能產生雄激素的卵巢腫瘤如睪丸母細胞瘤、含腎上腺皮質瘤，卵巢門細胞瘤等，因雄激素能抑制卵巢功能而致閉經，常伴有陰蒂肥大、多毛、音調變粗等男性化體征。能產生雌激素的卵巢腫瘤如顆粒細胞瘤、卵泡膜細胞瘤等，因雌激素過量可抑制排卵，并使子宮內膜過度增生而致閉經。

4、卵巢功能早衰：

正常婦女在45～52歲左右絕經，在40歲以前絕經的稱為卵巢功能早衰。卵巢功能早衰的原因不明，有認為可能與染色體異常有關。