小陰莖：

　　妊娠第6周開始出現原始性腺，第8周原始性腺分化成功能性睪丸，具備了分泌睪酮的能力。性器官進一步分化的方向取決于胎兒在發育過程中有無一定數量的睪酮能力，即便是男胎兒，也必須要有適量的睪酮，才能保證胎兒性器官朝著男性分化發育。某些藥物或患慢性疾病，可使胎兒性器官發育受到抑制，如原發性曲細精管發育不全征（Klinefelter綜合征）的小陰莖，但這也可能是某種遺傳基因的影響，常有一條額外的“X”染色體（47XXY），其發生率約為男性嬰兒的1/500。這種陰莖在解剖上是正常的，只是陰莖、睪丸都特別小，并伴有不育和性欲低下。

　　后天發育遲緩:

　　出生后在性器官發育期間，由于患慢性疾病致全身性營養不良，造成全身發育遲緩，性器官發育也受到抑制，成年后陰莖發育稍差，但功能正常。另一種是肥胖兒童，由于血睪酮含量稍低，陰莖發育遲緩，與同齡兒童相比差異明顯。從13歲起適當給予小劑量睪酮，提高血睪酮濃度，有利于性器官的發育，與此同時必須節食，并加強身體鍛煉以利減肥。成年后若陰莖發育較差，同時影響夫妻性生活時，可作陰莖延長術。

　　包莖或包皮過長:

　　學齡前兒童仍為包莖或包皮過長時，將阻礙陰莖的正常發育。有些國家將每年的5月某日定為“包皮節”，凡是年滿5歲的男孩若有包皮過長癥，必須作包皮環切術。據統計，在青壯年陰莖發育不良的647例患者中，曾經包莖或包皮過長者462例。陰莖的發育分為3個階段：胎兒分化發育；出生后至6歲為幼兒期發育；6歲后至12歲陰莖發育基本停滯，至13歲進入青春期階段，20歲陰莖發育成熟。家長應密切觀察孩子陰莖的發育增長情況，并定期進行測量以作為觀察陰莖發育數據的比較。若在12-18歲期間，陰莖仍未見正常發育，應適當給予小劑量丙酸睪酮25-50mg，每周2次，每年治療兩個療程（2個月），以促進陰莖的發育。若注射兩個療程仍無效時，應檢查性染色體、血睪酮、促卵泡成熟素、黃體生成素、24小時尿17-酮類固醇及孕三醇的含量，以便排除Klinefelter綜合征或性別畸形。成年后或陰莖勃起短于10cm時，宜行陰莖延長術。