南京市第二醫(yī)院(南京中醫(yī)藥大學(xué)附屬南京醫(yī)院，徐州醫(yī)科大學(xué)南京第二臨床學(xué)院，東南大學(xué)附屬第二醫(yī)院)，同時掛牌南京市腫瘤醫(yī)院、南京市老年病醫(yī)院。是江蘇省傳染病緊急醫(yī)學(xué)救援基地，艾滋病、結(jié)核病定點(diǎn)收治醫(yī)療單位。
占地面積480畝，總建筑面積10.9萬平方米，設(shè)置床位900張，現(xiàn)開放床位500張。是以消化道與呼吸道、接觸性與非接觸性等病種專科特色精細(xì)診療為主、綜合診療為輔，集防治、救援、應(yīng)急為一體的，全市重大公共衛(wèi)生事件應(yīng)急救治中心。設(shè)有感染病科、結(jié)核科、肝病科、綜合內(nèi)外科、重癥醫(yī)學(xué)科、一期臨床研究中心，麻醉科、醫(yī)學(xué)影像科（含介入室）、腔鏡室（支氣管鏡室、胃腸鏡室）等臨床醫(yī)技科室。
醫(yī)院有國家臨床重點(diǎn)專科1個，省重點(diǎn)學(xué)科、專科7個，市重點(diǎn)專科4個，國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)研究室1個。其中感染性疾病科為國家級臨床重點(diǎn)專科，感染性疾病學(xué)為江蘇省醫(yī)學(xué)重點(diǎn)學(xué)科。傳染科、腫瘤科、婦產(chǎn)科、普通外科、肝病科、結(jié)核科為江蘇省省級臨床重點(diǎn)專科，中西醫(yī)結(jié)合科為江蘇省示范中醫(yī)科，腸道及其他傳染病科、檢驗(yàn)科、醫(yī)學(xué)影像科、重癥醫(yī)學(xué)科為南京市臨床重點(diǎn)專科，中心實(shí)驗(yàn)室為南京市醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。